| VirtualDub
Функционал для редактирования mov в QuickTime платный. Бесплатно работать с файлами mov можно в программе VirtualDub. Для этого необходимо поставить в VirtualDub специальный плагин.
Создаем в папке VirtualDub папку plugins32. Распаковываем полученный архив в эту папку. Плагин работает, даже если его распаковать в папку plugins. Копируем файл Quicktime.ini (из распакованных) в корневую папку VirtualDub. Запускаем VitualDub.
Открываем файл MOV: 1.Щелкаем по пункту меню «File\Open video file…» 2.В селекторе файлов ставим галочку «Ask for extended options after this dialog»3.В списке типов файлов обязательно выбираем пункт «Quicktime videofiles (*.mov, *.mp4)» 4.Выбираем файл в списке и щелкаем по кнопке «Открыть»
5.В появившемся окне «Import options: Quicktime» выбираем Video Decoder Mode = «0 MoviesTask» 6.Жмём «OK» Работа с форматом MOV и MP4 будет доступна только в режимах Normal Recompress или Full Processing Mode. Конвертируем MOV и MP4 в AV
Источник: http://video-practic.ru/content/kak-rabotat-s-failami-mov | 
